負責醫學部學科規劃和建設及“統籌支持一流大學與一流學科建設”和“高等學校基本科研業務費”等學科建設經費的日常管理工作。
國家各部委、省、市、地區科研管理機構立項的科研項目及企事業委托項目的申報和過程管理。
醫學部國家級、省部級等重點科研基地及校內虛體科研機構的申報、換屆、考核等日常管理及服務工作。
科研論文、專利及其他知識產權、各類科技獎勵的申報、鑒定、管理及宣傳工作。
青年發展基金、青年科技獎、青年科技論壇、青年科技沙龍等青年科技平台的建設工作。
產業管理辦公室是醫學部主管成果轉化工作的職能部門,負責醫學部成果轉化項目的組織和實施,以及北大醫學科創中心管理及協調。